Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdc42bpbQ7TT50 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdc42bpbQ7TT50 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms