Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms