Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU6

Znf250, Zinc finger protein 250, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf250Q7TNU6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf250Q7TNU6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf250Q7TNU6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf250Q7TNU6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf250Q7TNU6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf250Q7TNU6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf250Q7TNU6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf250Q7TNU6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf250Q7TNU6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf250Q7TNU6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf250Q7TNU6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf250Q7TNU6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf250Q7TNU6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf250Q7TNU6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf250Q7TNU6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf250Q7TNU6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf250Q7TNU6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms