Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sbno2Q7TNB8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms