Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smap2Q7TN29 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms