Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms