Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SynmQ70IV5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SynmQ70IV5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SynmQ70IV5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms