Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sned1Q70E20 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms