Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trpv1Q704Y3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms