Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d2bQ6ZWY6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms