Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ncapd3Q6ZQK0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ncapd3Q6ZQK0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms