Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Topbp1Q6ZQF0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms