Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY7

Kdm3b, Lysine-specific demethylase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm3bQ6ZPY7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm3bQ6ZPY7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm3bQ6ZPY7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms