Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl3Q6W5C0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms