Protein–RNA interactions for Protein: Q6T3U4

Npc1l1, Niemann-Pick C1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1l1Q6T3U4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Npc1l1Q6T3U4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Npc1l1Q6T3U4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Npc1l1Q6T3U4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Npc1l1Q6T3U4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Npc1l1Q6T3U4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Npc1l1Q6T3U4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Npc1l1Q6T3U4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Npc1l1Q6T3U4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Npc1l1Q6T3U4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Npc1l1Q6T3U4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Npc1l1Q6T3U4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Npc1l1Q6T3U4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Npc1l1Q6T3U4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npc1l1Q6T3U4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npc1l1Q6T3U4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms