Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNU9

Tlr12, Toll-like receptor 12, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr12Q6QNU9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlr12Q6QNU9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlr12Q6QNU9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms