Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HjurpQ6PG16 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms