Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF93

Pik3c3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c3Q6PF93 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pik3c3Q6PF93 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3c3Q6PF93 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3c3Q6PF93 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3c3Q6PF93 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3c3Q6PF93 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3c3Q6PF93 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3c3Q6PF93 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3c3Q6PF93 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3c3Q6PF93 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3c3Q6PF93 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3c3Q6PF93 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3c3Q6PF93 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pik3c3Q6PF93 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pik3c3Q6PF93 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pik3c3Q6PF93 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pik3c3Q6PF93 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3c3Q6PF93 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms