Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtifQ6PEE2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtifQ6PEE2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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