Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slf2Q6P9P0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slf2Q6P9P0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms