Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam222bQ6P539 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms