Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sik3Q6P4S6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms