Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Podnl1Q6P3Y9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms