Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Slx4Q6P1D7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Slx4Q6P1D7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slx4Q6P1D7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms