Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pprc1Q6NZN1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pprc1Q6NZN1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pprc1Q6NZN1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pprc1Q6NZN1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Pprc1Q6NZN1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pprc1Q6NZN1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pprc1Q6NZN1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pprc1Q6NZN1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pprc1Q6NZN1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pprc1Q6NZN1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pprc1Q6NZN1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pprc1Q6NZN1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pprc1Q6NZN1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pprc1Q6NZN1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pprc1Q6NZN1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pprc1Q6NZN1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pprc1Q6NZN1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pprc1Q6NZN1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pprc1Q6NZN1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pprc1Q6NZN1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pprc1Q6NZN1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pprc1Q6NZN1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pprc1Q6NZN1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pprc1Q6NZN1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pprc1Q6NZN1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Pprc1Q6NZN1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms