Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpdc1Q6NZK8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpdc1Q6NZK8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms