Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.06■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
2810408A11RikQ6NSU2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.05■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.05■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.03■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.03■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.03■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2810408A11RikQ6NSU2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
2810408A11RikQ6NSU2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms