Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pdcd11Q6NS46 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pdcd11Q6NS46 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms