Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atg16l2Q6KAU8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg16l2Q6KAU8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms