Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
CltbQ6IRU5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms