Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ParpbpQ6IRT3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ParpbpQ6IRT3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ParpbpQ6IRT3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ParpbpQ6IRT3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ParpbpQ6IRT3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ParpbpQ6IRT3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ParpbpQ6IRT3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ParpbpQ6IRT3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ParpbpQ6IRT3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ParpbpQ6IRT3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ParpbpQ6IRT3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ParpbpQ6IRT3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ParpbpQ6IRT3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ParpbpQ6IRT3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ParpbpQ6IRT3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ParpbpQ6IRT3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ParpbpQ6IRT3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ParpbpQ6IRT3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ParpbpQ6IRT3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ParpbpQ6IRT3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ParpbpQ6IRT3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ParpbpQ6IRT3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ParpbpQ6IRT3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ParpbpQ6IRT3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ParpbpQ6IRT3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms