Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Best3Q6H1V1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Best3Q6H1V1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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