Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nckap5lQ6GQX2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms