Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Carmil1Q6EDY6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Carmil1Q6EDY6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms