Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cep170Q6A065 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cep170Q6A065 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms