Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ltn1Q6A009 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms