Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Thsd7aQ69ZU6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Thsd7aQ69ZU6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Thsd7aQ69ZU6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Thsd7aQ69ZU6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Thsd7aQ69ZU6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Thsd7aQ69ZU6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Thsd7aQ69ZU6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Thsd7aQ69ZU6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Thsd7aQ69ZU6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Thsd7aQ69ZU6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Thsd7aQ69ZU6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Thsd7aQ69ZU6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Thsd7aQ69ZU6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Thsd7aQ69ZU6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Thsd7aQ69ZU6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Thsd7aQ69ZU6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Thsd7aQ69ZU6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Thsd7aQ69ZU6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Thsd7aQ69ZU6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Thsd7aQ69ZU6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Thsd7aQ69ZU6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Thsd7aQ69ZU6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Thsd7aQ69ZU6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Thsd7aQ69ZU6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms