Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jmjd1cQ69ZK6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms