Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkp4Q68FH0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms