Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sptbn2Q68FG2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms