Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pan3Q640Q5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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