Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ccdc18Q640L5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ccdc18Q640L5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccdc18Q640L5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
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