Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

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Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa17Q64016 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa17Q64016 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa17Q64016 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa17Q64016 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa17Q64016 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa17Q64016 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa17Q64016 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa17Q64016 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa17Q64016 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa17Q64016 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa17Q64016 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa17Q64016 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa17Q64016 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa17Q64016 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa17Q64016 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa17Q64016 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa17Q64016 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa17Q64016 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa17Q64016 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa17Q64016 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa17Q64016 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Defa17Q64016 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Defa17Q64016 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Defa17Q64016 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Defa17Q64016 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Defa17Q64016 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa17Q64016 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms