Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a5Q63ZW6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms