Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup62Q63850 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup62Q63850 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms