Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Lcn4Q62472 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn4Q62472 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn4Q62472 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Lcn4Q62472 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Lcn4Q62472 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Lcn4Q62472 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Lcn4Q62472 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn4Q62472 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn4Q62472 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn4Q62472 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn4Q62472 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn4Q62472 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn4Q62472 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn4Q62472 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn4Q62472 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn4Q62472 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn4Q62472 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn4Q62472 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn4Q62472 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Lcn4Q62472 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn4Q62472 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Lcn4Q62472 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn4Q62472 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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Lcn4Q62472 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn4Q62472 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Lcn4Q62472 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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Lcn4Q62472 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Lcn4Q62472 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Lcn4Q62472 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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