Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vat1Q62465 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vat1Q62465 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms