Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl12Q62401 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl12Q62401 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl12Q62401 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms