Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms