Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ss18Q62280 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ss18Q62280 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ss18Q62280 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ss18Q62280 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ss18Q62280 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ss18Q62280 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ss18Q62280 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ss18Q62280 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ss18Q62280 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ss18Q62280 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ss18Q62280 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ss18Q62280 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ss18Q62280 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ss18Q62280 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ss18Q62280 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ss18Q62280 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ss18Q62280 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ss18Q62280 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ss18Q62280 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ss18Q62280 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ss18Q62280 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ss18Q62280 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ss18Q62280 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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